目前在专业文献、新闻报刊中有许多干细胞的词汇和术语，但经常被混淆和误解。当今，干细胞生物学领域正以令人难以置信的步伐向前发展，在所发表的各种生物医学的论文中，几乎每周都有新的发现。因此，对干细胞及其相关术语进行科学的界定十分必要。  

   分化（differentiation）分化是一个过程。在分化的过程中，细胞内一些特定的基因开始表达，而其它基因并不表达，从而一个非特化的细胞特化成为一个具有特殊结构并执行一定功能的细胞。例如，干细胞分化为神经细胞，神经细胞具有薄的纤维状的保护膜，负责发出和接收电化学信号，其促使该神经细胞和其它的神经细胞进行传导。在实验室中，干细胞可以人为地操纵。使其向某一种类型的细胞分化，如心肌细胞、肝细胞或胰腺细胞。 

   祖细胞（progenitororprecursorcell）胚胎和成体组织中的祖细胞是部分特化的，它可以分裂并产生某种类型的细胞。研究人员可以通过以下特性鉴别祖细胞和干细胞：当一个干细胞分裂时，两个子代细胞中至少有一个是具有自我复制能力的干细胞；而当祖细胞分裂时，它可以形成两个祖细胞或者是产生两个分化细胞，但是这些细胞都失去了自我复制的能力。 

   骨髓细胞（bonemarrowcell,BMC）包括不同发育阶段的血细胞（造血干/祖细胞、形态上可识别的幼稚的血细胞和成熟的血细胞）和造血基质细胞（巨嘘细胞、成纤维细胞、间充质细胞等）。 骨髓干细胞（bonemarrowstemcell,BMSC）至少包括两种类型的干细胞：造血干细胞（hematopoieticstemcell）和骨髓间充质干细胞（mesenchymalstemcell。  

   间充质干细胞（mesenchymalstemcell）中胚层发育的早期细胞，不仅可以分化为造血实质和造血基质细胞，还可以分化为许多造血以外的组织，特别是中胚层和神经外胚层来源组织的细胞。