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细胞培养污染的检验与去除
[ 文章来源: | 文章作者: | 发布时间:2007-05-28|  字体: [ ]  


上一篇: 细胞培养常见问题及解决方法   下一篇: 细胞培养过程中的注意事项及试剂配制
细胞培养污染的检验与去除
1.细菌与霉菌的污染
由于环境条件差和操作不当等原因,常可发生细菌和霉菌的污染。常见污染的细菌
有革兰阴性菌如:大肠埃希菌、枯草杆菌、假单胞菌等;革兰阳性菌有葡萄球菌等,真
菌污染常可发生,尤其炎热、潮湿的季节十分常见,如烟曲霉、黑曲霉、毛霉菌、孢子
苗等。霉菌和细菌生长迅速,能在短时间内抑制细胞生长,或产生有意物质杀死细胞
镜下可见脑浆内出现大量颗粒,细胞变圆或崩溃,从瓶壁脱落。霉菌污染容易发现,大
多形成白色或浅黄色菌团漂浮于培养液表面,肉眼可见,有的散在生长,镜下可见丝状
菌丝,纵横交错于细胞之间。细菌污染如果较严重时培养基上清混浊,较轻时镜下可见
小的菌体在细胞间运动,同时可涂片染色镜检或进行细菌培养基培养,加以确定。
抗生素及抗霉菌制剂对预防或排除细菌、霉苗污染均有效。工作中要特别注意和防
止所用培养液和血清的污染,日前应仔细检查有无混浊和菌丝存在,以防止在培养细胞
时造成污染。
2.支原体污染的检测与去除
2.1 支原体的检测
2.1.1 PCR 法
2.1.1.1 原理 该法是通过PCR 技术将支原体16s rRNA 基因特异性扩增,来检测培养细胞
中污染的支原体。PCR 引物选自16s rRNA 基因上的支原体特异片段,此片段与其他细菌的序列无交叉性杂交反应。扩增产物用琼脂糖凝胶电泳,经溴乙啶(EB)染色后在紫外透射仪上进行检测。
*16s r DNA 引物用水稀释至40μmol/L。
(1)正向引物:5’-ACTCCTACGGGAGGCAGCAGTA-3’
(2)反向引物:5’-TGCACCATCTGTCACTCTGTTAACCTC-3’
*质粒pBR322 引物用水稀释至40μmol/L.
(1)正向引物:5’-CATCTCGGGCAGCGTTGGGT-3’
(2)反向引物:5’-AGCGCAAGCGGAGTCAGTGAGC-3’
*裂解缓冲液:10mmol/L Tris-HCL(pH8.3),50mmol/L KCL,2.5mmol/L MgCl2,5g/L Tween20
和5g/L TritonX-100。
*蛋白酶K(proteinase K)贮存液:蛋白酶K 20 mg/mL 溶于50%甘油中,于-20℃贮存。
*耐热DNA 聚合酶(如Taq 聚合酶)与相应的10×TAE 缓冲液
*琼脂糖(分子生物学级);EB(10mg/mL 溶于水中并避光保存)。
*6×加样染液(40%甘油、0.125% 溴酚蓝和125mmol/L EDTA).
*DNA 分子量标志(50ng/mL)、pBR322 DNA。
*PCR 仪、台式离心机、微波炉、电泳装置、紫外透射仪(UV)、加样枪、PCR 管(0.5mL
或0.2mL)。
2.1.1.2 方法与步骤
1)样品制备
(1)将106 细胞悬液或贴壁细胞刮下来的悬液放1.5mL 微离心管内,以最大转速离心15min。
(2)弃去上清,将细胞再悬浮于100μl 裂解液中,然后加蛋白酶K,使终浓度为60μg/mL。
(3)置微波炉内60℃孵育1h,然后升至95℃ 10min,再将样品置室温中降温。
2)PCR 扩增
(1)在冰浴中对各样品制备PCR 重要混合物,对每个样品均加入:
10×PCR 缓冲液 5.0 mL
25mmol/L dNTPs 混合物 0.4μl
40μmol/L 16sr DNA 引物 每种引物1.0μl
40μmol/L pBR322 DNA 引物 每种 2.0μl
pBR322 DNA 1pg/mL 2.0μl
DNA 聚合酶(5U/mL) 0.2μl
三蒸水 35.4μl
总量 45μl
(2)用无菌去离子水稀释样品为1:10,1:100。
(3)于每个eppendorf 管中加45μl PCR 扩增混合物,每管中分别加入样品原液及1:10,1:100 稀释液各5μl,操作均在冰浴中进行。
(4)在每个eppendorf 管中轻轻加入50μl 无菌矿物油,覆盖在液面上。如DNA 扩增仪带有有制式热盖,此步骤可省略。
(5)将各管放入DNA 扩增仪的孔槽内,并执行以下循环指令:
95℃ 10min 一个循环;
95℃,30S → 58℃ 1min → 72℃ 1min,共30 个循环;
最后72℃ 10min 延长循环。
3)PCR 产物分析
(1)制备含有EB 染料(0.1μg/mL)的1%琼脂糖凝胶(用TAE 缓冲液制备)
(2)从PCR 扩增仪中取出样品管,取10μlPCR 扩增产物加到2μl 带有染液的加样液中,混匀后加样到琼脂糖凝胶加样孔中,同时在对照孔中加10μl 标准DNA 分子量标志。
(3)凝胶置TAE 缓冲液中,电压80V,电泳 60-90min。
(4)凝胶电泳完毕,将凝胶置紫外透射仪下观察,有无被EB 染料着色的红色荧光DNA 条
带,样品孔与标准DNA 孔进行比较并拍照。
2.1.1.3 质控与提示
1)阳性对照
(1)如果支原体DNA 可查到,则10ngDNA 即呈阳性结果。
(2)如得到已知支原体感染的细胞培养,细胞可同样品一样处理,作为阳性对照,处理的
细胞置-20℃冻存,可重复使用。
2)阴性对照
(1)用45μl PCR 扩增液加5μl 无菌去离子水混匀,作为阴性对照。
(2)在含45μl PCR 扩增液的eppendorf 管中建立一个对照孔,以2μl 无菌去离子水替代
pBR322 DNA(1pg/mL)。
(3)有时样品中可能含有聚合酶的抑制物,可阻抑PCR 扩增,这种情况很易被pBR322 扩
增片段的缺失所识别。遇此情况是,应从同一培养物中另取少量细胞(105 个)重新制备一
份样品,如果这样做仍无扩增片段出现,就将细胞在无抗生素的培养基中试生长2-3 周,然后再作支原体检测。因为抗生素能结合双链DNA,故有人怀疑抗生素具有抑制Taq 聚合酶的活性。
2.1.2 DNA 荧光染色法
2.1.2.1 原理
DNA 荧光染色法是以Hoechst 或4 / -6- 二氨基-2 苯基吲哚( 4 /
-6-diamidino-2-phenylindole,DAPI)试剂为荧光染料,使支原体DNA 着色,用荧光显微镜
在感染的靶细胞的胞质中辩认出荧光,证明试验样品中存有支原体。
2.1.2.2 试剂与仪器
*靶细胞 CKI-1(IFO5003,JCRB0008)或Vero 细胞(ATCC CCL82)
*试验样品 约106 个细胞的培养上清液1mL
*支原体 mycoplasma hyorhinis (ATCC 29052) M.orale(IFO 14477)
*培养液 MEM+10%FBS(无抗生素)无钙镁 PBS 固定液;甲醇∶醋酸为3∶1
*荧光染液
①浓缩染液:100mLPBS 中加Hoechst Dye 5mg 防腐剂 thimerosal 10mg 用磁力搅拌器助溶
30min,每瓶分装1mL,严格避光保存于-20℃冰箱内
②使用液:将冻存的浓缩液取0.15mL加入100mLPBS中,(最终浓度为0.075μg/mL的Hoechst Dye 0.15μg/mL 的thomerosal 防腐剂)用磁力搅拌器搅拌助溶30min,使色素完全溶解。(使用前调制)
*荧光显微镜、各种吸管、60mm 玻璃平皿、10mL 离心管、4 个带有可活动玻片的培养皿、
盖玻片(无荧光)
2.1.2.3 方法与步骤
(1)检验材料的制备
①检体细胞的培养:被检细胞在不含有抗生素的培养中传代培养3 次以上(不低于3 次)在最后一次传代培养增殖期中换新鲜培养液,经2-3 天培养。
细胞回收:培养细胞上清液,以及用橡胶刮匙从培养皿上刮上的细胞,吸入离心管内,于
4℃下,1200r/min,离心10min。吸弃上清,留下约含106 个及大约1mL 上清液。
③冻融:将离心细胞收集到冻存管内置-20℃冻结,30min 后置37℃孵箱内融解,如此反
复操作2 次,于4 1200r/min ℃ 离心10min,吸取上清液作为检体。
(2)标记靶细胞培养与检体的接种
①将液氮(-196℃)冻存的CKI-1 或Vero 细胞解冻(37 1 ℃ 分钟内迅速解冻)计数活细胞达2-3×103/mL,植入4 个带有可活动的切片在皿底的培养皿中,每培养皿1mL,置CO2 孵箱内培养。
②孵育24h 后在显微镜下见细胞呈适当的密度(高倍镜下见160-240 个细胞/视野)时,
弃去培养液,于每个带可活动切片平皿内换新鲜培养液0.9mL,在i 号皿内接种冻融检体
0.1mL 在ii 号皿内加0.1mL 培养液,作为阴性对照,iii 与iv 号皿内加入100cfu/0.1mL 的
M.hyorhinis 和M.orale 支原体液,作为阳性对照。将4 个培养皿置CO2 孵箱内培养6 天。
(3)细胞固定、染色、封片观察
①吸弃培养液,用CMF-PBS 洗涤细胞加在可活动玻片上1mL 固定液,固定10min。
②吸弃固定液,风干后各加染色液,置室温染色30min。
③吸弃染色液,用蒸馏水洗3 次,取下可活动玻片的杠架和垫圈,取下可活动玻片。
④滴入封片液,其上复上盖玻片并赶除气泡和多余的封片液,四周用封片胶封闭。
⑤启动紫外系统,用荧光显微镜观察(放大约×400-600 适宜)
(4)结果判定
①在细胞质中观察有无荧光,试验样品与阳性、阴性对照对应观察。
②计数1000 个细胞,有5 个以上的细胞质中见荧光着色,可判定为阳性。
2.1.2.4 质控与提示
(1)标记的靶细胞除CKI-1 和vero 细胞外,3T6 细胞(ARCCCCL96)也可使用。本法成功的要点之一是用作靶细胞质控的管理应严格,必预先确认该细胞无支原体的污染才能冻存使用。
(2)要明确本检体的结果判定,必须使用不含抗生素的培养液。
(3)染色液:Hoechst 染液不稳定,故每次检测前须新鲜配制,使用DAPI 也可以,均应新鲜配制。
(4)试验检体:被试细胞回收时用橡胶刮匙刮下,不能用胰蛋白酶等水解酶类消化,制备
好的检体细胞保存在-80℃冰箱中可存放数月。
(5)阳性对照:本试验采用支原体M.hyorhinis 和M.orale 为阳性对照,要十分注意避免有新的污染源。
(6)特异性与敏感性:本法不是支原体的特异性检出法,对DNA 进行染色观察,对其他
微生物(细胞内寄生的霉菌、细菌等)的污染,也可看出同样的荧光染色,甚至检体会含有
细胞的DNA 颗粒,都是引起结果判定混乱的原因。但细胞培养所污染的支原体,M.hyorhinis、M.orale、M.salivariμm、M.hominis、M.fermentans 等约占支原体污染的97%,本法针对这些支原体污染的检出敏感度为1cfu,而一般污染细胞中的支原体浓度为103-108cfu/mL,故本法仍具有很好的实用性。
2.2 支原体的去除
由于支原体对细胞培养的交叉污染严重并在无意识之中发生,故对支原体检测为阳性的
细胞株应丢弃;只对某些贵重的细胞株而言,才设法去除支原体。常用方法有药物法、免疫
法、稀释法、加热法等。从感染的细胞系中去除支原体较简单的方法是用阻碍支原体DNA
或RNA 合成的抗支原体类抗生素处理细胞。普遍的抗生素在细胞培养液中对支原体是无效
的。而用于去除支原体的药物均为喹诺酮类和/或四环素类抗生素的衍生物。
2.2.1 试剂与仪器
*抗支原体药物:四环素与截短侧耳素的复合物(BM-cyclin);卡那霉素、二甲胺四环素与
胼胝素协同使用,氟代喹诺酮类抗生素等,已有成品供应。
*细胞培养基:25cm2 组织培养瓶
*金属通风橱、CO2 孵箱、离心机等
2.2.2 方法与步骤
1.药物法 细胞的去除支原体处理
(1)支原体污染的细胞以105 个细胞/mL(25cm2 培养瓶中约10mL)接种于常规培养基并加有抗支原体药物,药物浓度为理论(想)值IC50。, 即采用5~10 倍于常用量的冲击法。
(2)培养48h 后,去除培养液,恢复原先处理,并在1 周内重复同样的处理。
(3)培养1 周后,将细胞接种于常规培养基内。
(4)常规培养2 周后,用前法所述检测细胞有无支原体污染,如果无支原体检出,则重复
实验。2 至3 周后再次检测以确定该结果,经这样处理的细胞认为是无支原体污染的。
2.免疫法
要用抗支原体抗体或人及动物血清中的补体与污染细胞株于体外培养。支原体结合并裂
解破坏支原体。或用动物接种法将污染支原体的肿瘤细胞接种于同种系动物皮下或腹腔,或
接种于裸鼠腹腔,利用动物体内免疫系统杀伤支原体。
3.克隆法
克隆法即有限稀释法。将污染支原体的细胞进行有限稀释,接种于96 孔培养板,使之
每孔只接种一个细胞,进行克隆培养,经前法检测,挑取无支原体污染的细胞克隆,这种方
法对污染较轻的细胞株效果好。
4.加热除去
根据支原体对热耐受性较差的特点,将受支原体污染的细胞置于41℃中作用5~10h,最
长可达18h,以杀灭支原体,但41℃对培养细胞本身也有伤害,故在处理前应欲试验摸好条
件。另外有人利用软琼脂技术,经50℃加热(4~6min)灭活污染细胞的支原体,再于37℃
培养1~3 天,使琼脂中抗生素与支原体进一步作用,使热灭活的支原体彻底被清除。
3.内毒素污染的检测与去除
3.1 内毒素含量测定
3.1.1 原理 本法应用鲎变形细胞溶解物(limμlus amoebocyte lysate,LAL)LAL 来检测和
/或定量革兰氏阴性细菌的内毒素,称鲎试验,鲎试验的机制是内毒素活化LAL 中前凝固
酶而使凝固蛋白原变不凝固蛋白,使LAL 出现肉眼可见的凝胶从而可定量测知内毒素的含
量。
3.1.2 试剂和材料
*待测样品
*用λ 表示鲎试剂的敏感性单位(例如,λ=0.125EU/mL)(有商业成品)
●对照标准内毒素(CSE)(有商业成品)
●不含内毒素的水(即LAL 水)(有商业成品)
*硼硅酸盐制,锥形终末反应试管(内径10mm,长75mm)(内毒素测定专用,有商业成品)
*不含内毒素的氢氧化钠(0.1mol/L)
*不含内毒素的盐酸(0.1 mol/L)
*末被内毒素污染的硼硅酸玻璃制成的稀释用试管。
*指示温度计
*37±1℃恒温水浴箱。
*200 和1000μl 的微量移液管有未被内毒素污染的管头。
*无内毒素吸管(10、5、2 和1mL)
*PH 计或PH 试纸
*螺旋搅拌器
*能够保持250 1 ℃ 小时的干烤箱。
*聚膜(parafilm)
3.1.3 方法与步骤
测定内毒素水平需要进行两步(1)确定LAL 试剂的敏感度(2)检测待测样品中是否
存在可能导致假阴性结果的干扰因素。
1.确证鲎试剂的敏感度
(1)根据CSE 的初浓度,用LAL 水将CSE 连续二倍比稀释,稀释后的浓度为2λ,1λ,0.5λ,
0.25λ(例如,如果λ=0.125EU/mL,则浓度分别为0.25,0.125,0.0625 和0.0312EU/mL)
(稀释管的体积是0.1mL)
(2)将各0.1mLCSE 稀释液转移到锥形末反应管中,然后向各管中加入0.1mL 的LAL 试
剂。
(3)用封口膜封闭管口并轻轻混匀。
(4)37±1℃下孵育60 分钟,轻柔地倒置试管(180°),不要振荡,观察结果。
当内容物形成坚实的凝胶,倒置试管后,凝胶仍然附着在管底,该结果为阳性。在每组
稀释液中,具有最低稀释浓度的CSE 稀释液应呈阴性结果,如果均呈阳性结果,应提高稀
释倍数,再进行试验。
(5)测定的终点是每组稀释液中最后出现阳性结果的稀释液的浓度。
GEP=10m,m=∑e/f,其中e 为各组稀释液的终点的log 值的总和,f 为稀释液的组数。
如果计算出的GEP 介于0.5λ 与2λ 之间,可确证鲎试剂的敏感度。
2.对干扰因素的检测
(1)用待测样品将CSE 稀释成上述终浓度。
(2)测定混合液的pH 值,并用不含内毒素的NaOH 或HCL 将该混合液的pH 值调至6.5-7.5。
(3)重复上述测定GEP 的发骤,计算GEP 值。如果GEP 值介于0.5λ 和2λ 之间,则样品中不包含干扰因素。否则,提高样品的稀释倍数,重复测定。
3.对样品的定量测定
(1)A:准备两试管,分别盛浓度为2λ 和0.5λ 的CSE。(0.1mL,用LAL 水二倍比稀释)
B:用LAL 水将样品稀释,准备两组样品稀释液。(终体积为0.1m1,二倍比稀释)
C:用LAL 水作为阴性对照。(0.1m1)
D:向样品中加入CSE 至CSE 浓度为2λ,以此作为指示样品中是否含有
(2)干扰因素的对照(0.1m1)
重复前述步骤,向各管中加入0.1m1 的LAL 试剂。
(3)如果实验有效,则必须:
①呈阴性结果(排除因试剂中含有内毒素而导致假阳性)
②呈阳性结果(排除干扰因素)
③确证了细胞溶解产物的敏感度。
(4)样品内毒素浓度:λ×B 的终点。
3.1.4 质控与提示
(1)对于一般性的内毒素,可用CSE 代替较贵的参考标准内毒素(RSE),使用时将CSE
和BSE 对比校正。
(2)使用前,剧烈振荡CSE,使其悬浮。
(3)轻柔振荡鲎试剂使其悬浮,避免起泡。
(4)实验应在空气不流动的房间里,无菌的操作台上进行,使用末被内毒素污染的材料。
3.2 内毒素的去除
3.2.1 原理
本法用于去除实验用玻璃器皿上的内毒素。将玻璃器皿置于烤箱中,加热到250℃,持
续30min,即可去除内毒素。
3.2.2 方法与步骤
1.内毒素去除效率的评估
(1)制备浓度分别为1000 和1000EU/mL 的CSE 溶液。按内毒素测量方法检测这些溶液。
(2)向所有待去除内毒素的玻璃器皿滴入1mL 的CSE 溶液。(每种类型的玻璃器皿至少有3EU 的CSE。)
(3)将玻璃器皿置入烤箱中,在60℃下,干烤持续30min,烘干,然后在烤箱中,250℃
下,干烤30min。
(4)加入适量的LAL 水,剧烈振荡5min,以清洗玻璃器皿,然后测量清洗后的LAL 水中的内毒素的浓度。
(5)比较原来的内毒素含量和现存的内毒素浓度。
当内毒素含量至少减少了3-log 时,该方法有效。必要时,重复操作,去除内毒素。
用鲎试验法计算内毒素去除的百分比。
2.去除实验玻璃器皿上的内毒素
确定可使内毒素含量下降3-log 的最佳方案。
对于用来配置无同一内毒素溶液的玻璃器皿,重复操作,直至内毒素含量下降3-log。
(例如,1000→1EU 和10000→10EU)
数个加热循环后,用前述的鲎试验法,测定内毒素含量。
3.对照
阴性对照:用只盛有LAL 水的玻璃器皿,在250℃下,干烤30min 并用LAL 法测量内
毒素的含量。
阳性对照:干燥(60℃,30min)每种玻璃器皿中的内毒素溶液,不经过干烤(250℃,
30min)去内毒素的操作,然后测定其内毒素含量。
3.2.3 质控与提示
(1)确保烤箱散热均匀,为此,在操作过程中,可将玻璃器皿放置在烤箱中的每一层上,
当温度在250℃后,温度的波动不要超过±15℃。
(2)用含1000EU 的内毒素进行的检测,可用来确定去内毒素的效率。用含10000EU 的内毒素进行的检测,可用来确定对内毒素含量较高的器皿去除内毒素的效率。
(3)如果结果不理想,可增加每一次操作的时间和操作次数。
(4)其他技术适用于培养基的去内毒素,例如,超滤,反向渗透,但比较昂贵。选取有效
的滤过膜,确保去内毒素后,培养基的营养成分不丢失并且内毒素含量下降3-log。
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