此外，发展第一代生物燃料有可能影响粮价，其可持续性发展使人担心。

　　由于这些困难，专家认为已建立起来的美国和欧洲市场将有一个整合期。控制大部分供应链的是成本低一体化生产商，还有那些在资金上很有实力的厂商，他们能平安度过目前的下降期。

　　根据报告的生物燃料国季度吸引指数，生物燃料投资排在前15的投资市场中，投资下降最明显的是美国、巴西和欧洲这些主要市场。

　　尽管行业发展减慢，但美国的生物燃料吸引指数仍最高。据报告说，原料价格高、生产能力过剩和配送链瓶颈也放慢了投资。

　　仅次于美国的是巴西、法国和德国分别居第3和第4。荷兰和印尼分别居第14和第15。

　　报告说，对于乙醇，尽管需要满足管理上的规定使原料价高、生产能力过剩，市场面临盈利减少，美国下一季度的投资可望放慢，但美国的玉米制乙醇排在巴西的甘蔗制乙醇前。

　　据报告说，第三季度，美国和巴西仍是生物柴油投资的两个亮点，巴西以大豆油为原料的生物柴油工业取代了作为世界上第二大最有吸引力的生物柴油市场的法国。

　　Ernst&Young认为，欧洲的生物市场会继续受到美国B99生物柴油出口的严重影响。这种燃料可以享受1美元/加仑的税收优惠，也可从欧盟在政治上的支持中得益。