第12章
名词解释:
1. 复制子
答:任何在细胞里包含复制起始位点的DNA片段都可看成复制子。
2. 单复制
答:每个单倍体生物只有一个染色体,这种类型的复制就叫做单复制。
3. D-loop结构
环状双链DNA的复制起始于一个特殊的位点。但最初仅一条母链(哺乳动物线立体DNA的H链)用作新链合成的模板。合成仅进行一小段距离,置换出保持单链的初始互补链(L链)。这种结构称为D-loop结构。
4. 单拷贝控制系统
答:类似于细菌染色体在每次细胞分裂中只复制一次。单拷贝质粒能有效维持其与细菌染色体间的等量性。
5. 多拷贝控制系统
答:充许每个细胞循环中多次复制启始,导致每个细菌中有多个质粒拷贝。每个细菌染色体中多拷贝质粒都有典型数量(10—20个)
6. 逆转录
答:象RNAI那样和在同一区域被编码的RNA有互补功能,能够以DNA为模版进行转录的转录功能。
问答题
1.如何区分一个复制叉是单方向的还是双方向的?
答:1)对于有限的线性分子,我们使用电子显微镜测量在不同时刻“复制眼”的两端与DNA末端的距离的变化情况,如果复制是单向的,那么
“眼睛”只有一端能够移动,另一端是固定的;如果复制是双向的,则两边都移动,起始位点是两端的中间位置。
2)对于大型基因的不确定区域,可以用两次连续脉冲标记复制叉的运动,并能通过自动放射自显影照像区分出标记强度区分出;单向复制两端具有不同类型的标记,而双向复制两端具有同一种类型的标记。这种方法常用来观察真核染色体的复制。
满足复制线性DNA末端的需要几种解决方案:
2.为确保细胞分裂正常进行,细菌复制子应发挥哪些作用?
答:1)起始复制循环。
2)控制起始发生的频率。
3) 将复制后的染色体分配到子细胞中。
3.细胞分裂中的复制有什么特征?
答:不管是原核生物还是真核生物,在一次细胞分裂过程中,基因组中的所有复制子都要被复制一次,而且只能复制一次。
4.简述滚动环式复制的机制
答:滚动环是环状DNA分子复制的形式之一。一个起始点上打开缺口而形成引物端,DNA的一条链由此端合成,取代了原先的伴随链并像尾巴一样挤出来,环继续滚动,将形成多基因组。
5.细菌的复制和细胞的生长的两个联系:
答:1、复制循环的起始频率通过调整与细胞的生长相适应。
2、复制循环的完成与细胞的分裂相结合。
6.复制循环按两个常量形式定义
答:1、复制完全的细菌染色体时间约40min,这个固定时间被定义为C。
2、D是固定的20min,代表在复制完成一轮和它连接的细胞分裂之间的时间。
7.大肠杆菌E.coli染色体图谱的标准描绘原理
答:细菌染色体被转移的可能性主要依赖其与质粒F的oriT区的距离。离F整合因子位点近(在转化方向上)的细菌基因先进入受体菌,并且比那些距离远的后进入受体菌的基因表现出较大的转移频率。这样就形成从F整合因子起递减的围绕染色体的转移频率的梯度。供体菌染色体的标记位置能够按转移发生的时间顺序被检测。
8. 简述满足复制一个末端的需要的四种途径
答:(1)将复制子变成一个环形分子,如T4或λ噬菌体。
(2)DNA形成异常结构,例如末端形成发夹结构从而没有自由末端,Paramecium的线形线粒体DNA复制时产生交联。
(3)末端可以变化,而不是精确的确定。真核染色体可能采用这种方案,染色体DNA末端的短重复序列的拷贝数不固定。增加或减少重复单位的机制使得不必恰好从最末端开始复制。
(4)A蛋白质干扰使复制在真正的末端开始。几种病毒线形核酸有与5’末端碱基共价相连的蛋白。如腺病毒DNA,噬菌体φ29和脊髓灰质炎RNA病毒。
9. 简述fts 突变的意义
答:表明一种温度敏感的线状细菌。通常细胞形成无横隔的线状,多核规则地沿细胞长向分配。这表明缺陷在于细胞分裂过程本身。
10. 简述par (分裂)突变的意义
答:展示突变缺失位于染色体分裂,这是由于染色体DNA在细胞中的异常分配,无核细胞因此形成。这种缺陷可能位于DNA的操作。
11.简述trans突变(翻译突变)的意义
答:用于编码一种蛋白质,这种蛋白能引发细胞分裂,其中可能包含着可能与DNA结合的蛋白或着控制DNA可能外膜结合位点的活性。(已经发现两种类型的突变在质粒分裂系统中对其负责。仅有翻译突变功能在细菌染色体中被发现)。
第13章
1 Some temperature-sensitive bacterial mutants stop replication
immediately following elevation of temperature, whereas others continue
to replicate their DNA for a period of time before they cease this
activity, and still others continue until a round of replication is
completed. How might these three types of mutants differ?
2 Draw a partially double-stranded DNA molecule that would not serve
as a template for DNA synthesis by DNA polymerase I.
3 E.coli chromosome contains 4639221 base pairs. How many turns of the
double helix must be unwound during replication of the E.coli
chromosome.How many okazaki fragments would be formed,and how are
they assembled in the correct order?
4 What factors promote the fiedelity of replication duing the
synthesis of the leading strand of DNA? Would the lagging strand to be
made with the same fidelity as that of leading strand?
选择题
1 Base deamination can cause single base pair mutations because
a. Deaminated G structurally resembles U.
b. Deaminated G can base pair with U.
c. Deaminated C structurally resembles A.
d. Deaminated C can base pair with A.
2 In E. coli, parental DNA strands are distinguishable from newly
synthesized daughter DNA strands because
a. Parental strands are methylated and daughter strands are
unmethylated.
b. Parental strands are unmethylated and daughter strands are
methylated.
c. Parental strands are depurinated and daughter strands are not.
d. Parental strands contain point mutations and daughter strands
contain deletions.
3 A bacterial strain containing a mutant MutS protein that binds
equally well to methylated and unmethylated DNA would be expected to
a. Repair a single-base mismatch predominantly to the wild-type
nucleotide.
b. Repair a single-base mismatch predominantly to the mutant
nucleotide.
c. Repair a single-base mismatch half of the time to the wild type and
half of the time to the mutant nucleotide.
d. Be unable to correct a base pair mismatch.
4 Which of the following enzymatic activities does not play a role in
mismatch repair:
a. Helicase.
b. Single-stranded exonuclease.
c. DNA ligase.
d. Primase.
5 Which of the following enzymatic activities is not required for the
double-strand break repair model:
a. DNA endonuclease.
b. 5→ 3 exonuclease.
c. 3 → 5 exonuclease.
d. DNA synthesis.