第07章
问题1:蛋白质合成的三个中止密码子是什么?
参考答案:
UAA,UGA和UAG
问题2:请叙述摆动假说、产生原因以及对配对产生的影响。
参考答案:
摆动假说:在密码子与反密码子的配对过程中,密码子的前两个位置按照一般规则进行配对,但是例外的“摆动”出现在第3个位置上。
原因:“摆动”的出现是由于tRNA反密码子上的结构使反密码子的第一个碱基具有一定的灵活性。
影响:因为摆动,密码子上第3个碱基的识别规则承认G和U的配对。A在密码子中不再只具有唯一的意义,因为U能识别A也能识别G。C也不再只有唯一的意义,因为G能识别C也能识别U。当且仅当第3个碱基是G或U时,识别唯一的密码子是可能的。
问题3:氨基酸进入蛋白合成途径都要通过氨酰-tRNA合成酶。这种酶提供了一个与核酸相连结的分界面。所有的合成酶都按照两步的机理进行工作。请简述这两个步骤。
参考答案:
首先,氨基酸与ATP反应生成氨酰-腺苷酸,释放出焦磷酸。反应所需要的能量是通过打开ATP的高能酸酐键而获得的。
然后,被激活的氨基酸被转移到tRNA上,释放出AMP。
问题4: 核糖体是如何影响翻译的精确性的?
参考答案:
校正过程是通过检查A位置的氨酰—tRNA。大多数的错误是因为A位点上氨酰tRNA的错误识别造成的。配错的氨基—tRNA比与之竞争的正确氨基—tRNA更快的游离。
因此在A位点的停留时间有利于配错的氨基—tRNA避免缩氨酸的形成。
这一动力学的校正方法提高了正确氨基—tRNA的利用率。
这一效果可能是核糖体精确翻译在缩氨酸形成速度上体现的间接结果。
问题5:简述几种延伸因子.
参考答案:
延伸因子包括原核
生物的EF-Tu, EF-Ts,
EF-G和真核
生物的EF-1, EF-2.
其中,EF-Tu的功能是按照mRNA上的序列靶AA-tRNA带入大亚基A位.
EF-Ts的功能是使EF-Tu*GDP再生为EF-Tu*GTP继续参加肽链的延伸.
EF-G负责延伸机制中的移位过成. EF-1相当于EF-Tu,
EF-2相当于EF-G.
第08章
思考题:
1. 简述核孔复合体对于不同大小的物质进入的主动和被动机制。
2. 简述蛋白酶降解蛋白的过程。
第09章
问题:
1什么是极性效应?
答:一个转录单位中的一个无意突变能抑制转录单位中随后基因的转录。
2.PN的抗终止作用是如何实现的?
答:两种可能a.阻止RNA聚合酶暂停,从而使rho因子无法追上聚合酶b.直接减低rho释放转录产物的能力。
3.Rho依赖型终止子具有什么特点?
答:终止子前有一段富含C缺少G的序列。
4.转录终止的两种主要机制是什么?
答:a.在某一位点不需要其他因子协助仅依赖于内在终止子的终止机制。B.依赖于rho
因子的终止机制。
5.为什么在细菌终止中很少涉及到rho因子?
答:原核生物中,转录与翻译同时进行,即核糖体追赶RNA聚合酶。而rho因子也是顺着转录的方向追赶RNA聚合酶,若核糖体正好防碍了它的前进,则依赖rho的终止反应不会发生。
6.怎样能阻止转录的终止?
答:最常见的机制是抗终止。抗终止子是一种能识别终止序列上游的抗终止序列的的蛋白质,它帮助抗终止子所利用的底物与依赖DNA的RNA聚合酶的相互作用,通读下游的终止子序列。
第10章
1. 自体控制(autogenous control):
一个基因产物阻遏(正自动基因控制)或激活(反自动基因控制)该基因的表达的行为。
2. 严禁型反应(stringent response):
细菌在生长环境差的情况下停止大部分生命活动(主要是停止tRNA和核糖体的合成)的能力。
3. 超阻遏:突变型基因中,不能被诱导的状态。
4. 正面控制的基因和反面控制的基因如何被诱导?
答:正面控制的基因:诱导物激活无活性的活化因子使它活化,活化因子协助RNA合成酶,进行转录。
反面控制基因:
诱导物与阻遏子结合,使阻遏子失活,RNA合成酶就可以进行转录。
5. 正面控制的基因和反面控制的基因如何被阻遏?
答:正面控制的基因:辅助阻物与活性活化因子结合,使它失活,使RNA合成酶无法进行转录
反面控制的基因:辅助阻物激活无活性阻遏子,活化了的阻遏子阻止转录过程。
6. 弱化子:位于转录单元起始位置的内部终止子。
弱化作用:一种通过读完一个弱化子来控制RNA聚合酶能力的机制。
7. trp操纵子是如何调控的?
答:trp操纵子由两种独立的机制调控。抑制表达由结合到靠近启动子的操纵基因的阻遏蛋白(由分开的trpR基因编码)实现。弱化作用通过调节终止是否在第一个结构基因前的位点发生来控制RNA聚合酶在操纵子上的进程。
8. 调节子RNA起作用的一般机制是什么?
答:(1)与目标核苷酸形成双链区,通过形成或隔离一段特定位点直接阻止其起作用。(2)在目标分子一个区域形成双链区而改变了另一区的构象,因此间接影响其功能。这两种用RNA干预的调节的一个共同特点是通过改变目标二级结构而控制它的活性。RNA调节子与阻遏操纵子的蛋白质之间的一个不同点是RNA没有别构性质;它不能响应于其他小分子来改变识别其目标的能力。它能通过控制其基因转录而被开启,也能通过酶降解RNA调节子产物而被关闭。
9. 反义RNA被用作调节子的三种情况是什么?
答:一个反义RNA可能与一个RNA结合而封闭了核糖体结合的位点从而阻止蛋白质合成的开始;反义RNA也可以与目标mRNA结合形成限制性内切酶目标双链区,直接使其不稳定;反义RNA可能通过与转录物结合,模仿终止子使转录过早终止来影响基因表达。
判断正误:
1. 诱导物与阻遏子结合后,操纵基因的特异性降低 (T)
2. DNA中,阻遏子只能与操纵基因结合 (F)
3. 诱导过程中,诱导物与阻遏子结合,并释放自由的阻遏子,从而完成诱导(F)
4. 细菌在缺少氨基酸的环境中,可以通过减少rRNA和tRNA的生产,只进行最少的生命活动来维持生活 (T)
5. 一个阻遏蛋白只能在一个操纵子上起作用 (F)
6. 自发调控的一个特征是,每个调控的相互作用都是独一无二的,蛋白质只作用在负责其自身合成的mRNA上。 (T)
7. 弱化作用的普遍特征是一些内部因素控制着内部终止所需发卡结构的构象。(F)
8. 反式作用调节子只能是蛋白质。 (F)
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Science中文摘要2007年6月15日