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生物信息学所用的方法和技
NCBI-Coffee Break
[ 文章来源: | 文章作者: | 发布时间:2007-03-16|  字体: [ ]  
随着在分子生物学和信息技术科学的成功,出现了一个崭新的迅速发展的领域:生物信息学——数据收集,组织和计算分析的加工程序。生物信息学是一个生物的理论研究,使用计算机算法和已知的只是来从大量可获得的分子数据中发掘金子般有用的信息来。这些研究可以提供科学研究者新的解决生物医药问题的方向——现在很少有研究不会利用在线的数据分析,从文献检索到DNA序列搜索到3D分子模型。
NCBI是在NIH的国立医药图书馆的一个部分。它的任务是以供研究者使用和分析的方式来组织DNA序列和相关的数据。这包括那些必须的工具,如BLAST——序列相似搜索工具,和搜索引擎的设计,如PubMed——用于发掘生物医学摘要数据库,MEDLINE。
Coffee Break是在NCBI的一个新资源,综合了最近在生物医学领域那些使用了NCBI工具的发现。那些结果是交互式的学习指南,讲述一个生物学故事。每一个报告大约400个单词,常常是基于最近发表的同业互查文献的一个或多个文章的发现报道。一个把这个工作在宽广的背景中简短的介绍后,报告集中于一个分子的理解如何可以对观察生物学提供解释并且引向疾病治疗。
每一篇短文都伴有一个图片,还有超链接到一系列交互显示NCBI的工具和资源是如何在研究过程中使用的叶面。读者参与到一个用来显示一个工具或搜索引擎功能的预先设定的搜索中,并且扩大文章包含的内容。目前,这些文章特写了PubMed对MEDLINE的搜索和使用BLAST搜索GenBank。演示序列搜索也包括BLAST结果的分析,通常是以序列对齐的方式来说明故事中的生物学焦点。
Coffee Break计划的听众是分子生物学家,临床医生和学生。我们希望它们的确能提供信息,读起来有趣,而且可以为大学和研究生提供教育帮助。
最后:Coffee Break是一个对最新生物学发现收集的短的报道。每一个报告揉入了交互学习指南,用来演示生物信息学工具是如何作为研究过程中的一部分的。


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