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生物信息学所用的方法和技
从大规模质谱数据中挖掘磷酸化位点
[ 文章来源: | 文章作者: | 发布时间:2006-12-26| 字体: [
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随着蛋白质质谱技术应用的日益广泛产生了大量的蛋白质磷酸化相关的数据,对这些数据的分析使得我们有机会对蛋白质的磷酸化位点进行深入的研究。大多数对质谱数据的分析是建立在蛋白质或蛋白质组的水平上的,但是在最近的一篇Nature文章中,作者深入到肽断的水平,对磷酸化的肽断进行分析,提出一种基于概率统计的迭代算法,分析挖掘出了一批自然发生的磷酸化位点。为了验证这种算法,作者将其应用到语言学上进行检测,证明该算法确实能够找到那些发生频率比较高的词汇,从而说明文中所找到的蛋白磷酸化位点是有统计学意义的。这种算法的提出,为实验学家寻找蛋白质磷酸化位点提供了方便。
200505-nbt1146.pdf
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