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生物信息学所用的方法和技
science:生物芯片与基因发现
[ 文章来源: | 文章作者: | 发布时间:2007-08-28|  字体: [ ]  

        人类基因组测序工作的完成和分析序列变异的技术将促进全球的人基因的变异研究。用微矩阵技术来进行基因表达谱、基因型、突变检测和基因发现的研究,可以探知以前仅知道序列的成千个基因的功能。基于微矩阵的比较基因组学也是富有前途的,用来探索微生物感染的分子流行病学。用高密度的微矩阵寡核苷酸技术来研究Mycobacterium tuberculosis,检测小范围的基因缺失和研究与病原性减弱趋向相关的特定基因突变。

  小范围的DNA的单个碱基的变异称为单核苷酸多态性,通过基因来能够区分不同的个体。把包含SNP的寡核苷酸序列固定到表面,每个序列含有一个特定的SNP。为了确定个体基因组中是否存在SNP,从个体中得到的DNA同芯片杂交。如果一个特定的SNP存在,则荧光标记的基因组探针在相应位置上显示阳性信号。如果不存在,则不显示信号。一个明显的缺点是对每个个体必须用一片微矩阵或芯片进行检测,这可能是一个大规模的昂贵的检测。

  OmniScan(PolyGenyx Inc., Worcester, Massachusetts),把多个个体的基因组而不是SNPs固定到芯片上。因此,SNP的检测通过SNPs与固体表面的靶标结合而不是基因组序列。这样允许多达10000个体的DNA固定到一片上,然后同时分析它们。这个平行化处理的手段比大群体的系列研究要有效的多。

  SNP基因型和新出现的药物基因组学可能领导着大规模基因扫描和个体化诊疗,最适合个体基因型的医疗和用药。记录在一个生物芯片的个体遗传信息能够用来确定个体的疾病易感和最佳的治疗手段。在不久的将来,微芯片将作为病人手头或医生办公室手持式的诊断工具。自动的实验室设备可以扫描患者的基因组,通过计算机分析预测患者对特定药物的反应。因此,在几分钟内决定每个病人的理想治疗过程是可能的。但是在这样的技术可以使用之前,伴随着疾病遗传谱的隐私和伦理问题需要解决。

  医学的一个崭新的世纪展现在我们面前。微矩阵技术因为它的扫描和检测能力将帮助人类实现全面的保健和个体化治疗。

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