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《自然综述》探讨DNA芯片局限性
[ 文章来源: | 文章作者: | 发布时间:2007-08-22|  字体: [ ]  

        遗传和基因表达分析领域的科学进步革新了患者个性化治疗的概念。对上万个生物样本进步不同的基因表达模式分析和推测这些数据来回答临床问题(如肿瘤转移的可能)能有助于确定出针对特定患者的最佳治疗方案。

        新篇的使用提供了一种强大的技术,能够使人们深度分析基因表达特征。目前,芯片技术在利用科学信息来知道临床实践决策方面还处在一个过渡阶段。

        在芯片能用作临床工具前,还必须证实它们的可靠性和可重复性。芯片实验的高通量本质特性也有很大的局限性,如样品获得和信息采矿。在有效使用这种工具的同时,需要配套的相关生物学统计分析方法来分析获得的数量巨大的信息。

        此前进行的大量芯片研究中,研究人员已经推荐了一些使给出的基因表达特征有效和改善试验设计的方法。这篇《自然》综述集中分析了芯片分析的局限性,并讨论了如何克服这些局限性。

        文章列举了芯片用于临床的主要局限性:

        1.样品问题:芯片分析需要冷冻的肿瘤组织来确保RNA的质量,但是大多数医院中肿瘤样品都是直接用福尔马林固定然后用石蜡包埋的。

        2.寻找表达有差异的基因过程中的没一步骤还没有规范统一。

        3.分析获得的巨大数量的资料增加了统计分析的难度。

原始出处:http://www.nature.com/ncponc/journal/v3/n9/full/ncponc0587.html

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