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对芯片数据Lexial Bias的显著性分析
[ 文章来源: | 文章作者: | 发布时间:2007-08-22|  字体: [ ]  

所谓的Lexical Bias又称为Lexical trend,在我们分析芯片数据聚类分析结果时,那些处于同一代谢路径或实现同一代谢功能的基因经常被发现是共调节的,研究者称之为Lexial trend在分析Lexial trend结果时去除假阳性结果是非常重要的,因为只有真正的结果才对未来的实验设计有所帮助。现在已经有一系列的复杂方法用于Lexial trends的显著性分析。比方说在分析之前先进行功能聚类,或者利用Medline进行文献发掘等等,但是这些方法都有明显的缺陷,并且对普通的非专业的人员来讲可操作性比较差。

本文的作者发展了一种名为LACK的分析方法来计算芯片数据集合中可能的lexial bias的统计显著性。他们的软件以软件包形式发布(包含perl源码),不需要使用者具有生物信息学知识就可应用。

作者应用该软件进行了实际分析,取得了不错的结果。

 

想要了解更多,请见原文


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