3. 总RNA的提取。 ① 向上述步骤2的匀浆裂解液中加入氯仿(RNAiso Reagent的1/5体积量),盖紧离心管盖,用力震荡(氯仿沸点低、易挥发,振荡时应小心离心管盖突然弹开)。待充分乳化溶液呈乳白状(无分相现象)后,再室温静置5分钟。 ② 12,000 g 4℃离心15分钟。 ③ 从离心机中小心取出离心管,此时匀浆液分为三层,即:无色的上清液、中间的白色蛋白层及带有颜色的下层有机相。吸取上清液转移至另一新的离心管中(切忌吸出白色中间层)。 ④ 向上清中加入等体积的异丙醇,上下颠倒离心管充分混匀后,在15~30℃下静置10分钟。 ⑤ 12,000 g 4℃离心10分钟。一般在离心后,试管底部会出现沉淀。
4.RNA沉淀的清洗。 小心弃去上清,缓慢地沿离心管壁加入75%的乙醇l ml(切勿触及沉淀),轻轻上下颠倒洗涤离心管管壁,12,000 g 4℃离心5分钟后小心弃去乙醇(为了更好地控制RNA中的盐离子含量,应尽量除净乙醇)。 5. RNA的溶解。 室温干燥沉淀2~5分钟(不可以离心或加热干燥,否则R N A 将会很难溶解, 有关R N A 溶解可以参考Troubleshooting中的相关说明),加入适量的RNasefree水溶解沉淀,必要时可用移液枪轻轻吹打沉淀,待RNA沉淀完全溶解后于-80℃保存。
FAQs [Q1] 一般情况下每毫克的组织或1×106个细胞中所能提取的RNA量如下表:

[Q2] 有关RNA的吸光度说明如下: 260nm、320nm、230nm、280nm下的吸光度分别代表了核酸、背景(溶液浑浊度)、盐浓度和蛋白质等有机物的吸光度值。OD260/OD280(R)体现了RNA中的蛋白质等有机物的污染程度,质量较好的RNA的R值应在1.8~2.0之间,当R<1.8时,溶液中的蛋白质等有机物的污染比较明显;当R>2.2时,说明RNA已经被水解成了单核苷酸。在对核酸进行吸光度检测时,需要注意稀释液应使用TEBuffer。 [Q3] 如何计算RNA的浓度? RNA浓度=(OD260-OD320)×稀释倍数×0.04 μg/μl。 [Q4] 提取的RNA中含有多糖怎么办? 大多数的植物及动物肌肉组织中都含有大量多糖,其理化学性质与RNA十分接近,因此很难将其从RNA中除去,使用此类组织材料提取RNA时,建议增加RNAiso Reagent的使用量。 [Q5] RNA提取量较低怎么办? ① 向组织材料中加入RNAiso Reagent后,请充分研磨匀浆使其充分裂解。 ② 相分离后请尽量完全回收上清液。 [Q6] 提取的RNA不溶怎么办? ① 75%乙醇清洗沉淀后不要干燥时间过长或加热干燥。 ② 可以于60℃加热5分钟后再于冰上溶解数小时。 ③ RNA沉淀中含有不溶的蛋白质混合物时,应注意在相分离后吸取上清液时,不要让枪头接触蛋白层。 ④ 溶解液更换为0.5%的SDS溶液(DEPC处理水配制)。 [Q7] OD260/OD280值<1.65,为什么? ① RNA应使用TE Buffer稀释后再进行吸光度值的测定,低离子强度或低pH值会使OD280值升高。 ② 样品裂解时加入的RNAiso Reagent量偏少,造成蛋白变性不充分,可以再次对RNA溶液进行苯酚/氯仿抽提,以除去蛋白。 ③ 含有裂解液的样品经匀浆混匀后未在室温静置,或静置的时间不足5分钟。 ③ 提取的组织材料中含有大量的RNA分解酶,而RNAiso Reagent的添加量不够。 ④ 相分离后,吸取上清液时不小心接触蛋白层造成污染。 ⑤ RNA未充分溶解。 [Q8] 提取的RNA降解,为什么? ① 使用的组织材料不够新鲜。提取RNA的组织材料应采用新鲜的组织材料,或将新鲜的组织材料用液氮迅速冷冻后置于-80℃保存。 ② 提取RNA时使用的试剂及器材中混有RNA分解酶。 [Q9] 提取的RNA中含有DNA污染,为什么? ① 裂解组织或细胞使用的RNAiso Reagent量偏少。 ② 使用的组织材料中含有大量的有机溶剂(如:乙醇、异丙醇等)、高浓度的Buffer、碱性溶剂等。 ③ 如果提取的RNA中含有DNA时,可以使用DNase I (RNase Free;TaKaRa Code:D2215)进行DNA消化。
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