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| [ 文章来源: | 文章作者:
| 发布时间:2007-04-05|
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材料: (1)急性期病人血清、鼠肺、鼠血或分离的汉坦病毒 (2)引物:
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引物
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序列(5’~3’)
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位置
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片段(bp)
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逆转录引物
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TAGTAGTAGACTCC
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1~14
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LMS
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通用外引物
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AAAGTAGGTGITAYATCYTIACAATGTGG
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1910~1939
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M( )
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GTACAICCTGTRCCIACCCC
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2373~2354
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M(-)
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型特异性引物
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汉滩病毒
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GAATCGATACTGTGGGCTGCAAGTGC
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1958~1984
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M( )
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GGATTAGAACCCCAGCTCGTCTC
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2318~2340
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M(-)
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汉城病毒
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GTGGACTCTTCTTCTCATTATT
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1936~1957
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M( )
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TGGGCAATCTGGGGGGTTGCATG
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2331~2353
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M(-)
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S片段引物
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ATGTTGCCTGGGGIAAAGAGG
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1200~1220
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S( )
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GCGCACTAGTAGTAGTAGACTCCCTAAAGA
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1670~1696
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S(-)
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方法: (1)病毒RNA的提取:采用TRIzol按说明提取,制备模板RNA; (2)逆转录、合成cDNA:采用SuperScripTMII或AMV逆转录酶,按说明书进行; (3)PCR扩增:反应条件为95℃预变性10分钟,94℃60秒、55℃60秒、72℃45秒、扩增30~35个循环,72℃延伸12分钟。 (4)扩增产物用1~2%琼脂糖凝胶电泳鉴定。若条带的分子量与预期片段大小相同,则表明为特异性扩增产物。 必要时,可进行: (5)PCR片段的回收和核苷酸序列测定:切下特异分子量条带,用QIAquick凝胶回收试剂盒回收(按其说明书进行),自动测序仪测序。
意义:扩增到特异性条带可确诊汉坦病毒并明确其型别,序列测定还可以对汉坦病毒的变异情况进行研究。
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