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RNA分离纯化操作专用试剂选购指南
[ 文章来源: | 文章作者: | 发布时间:2007-05-28|  字体: [ ]  


上一篇: 各种不同样品DNA提取的建议   下一篇: PCR 引物设计及软件使用技巧
RNA分离纯化操作专用试剂选购指南
RNA的操作在核酸研究中非常重要,但必须特别注意两个问题:
(一)RNA的降解:由于RNase的存在(如实验器皿、样品、试剂等)且难以清除,使得RNA 的大幅降解,最终影响RNA的产量。
(二)RNA完整性:如果在分离纯化中不能保证RNA的完整性,那么在后续的实验中很难得到完整的cDNA、
PCR产物等全序列RNA
本指南旨在提醒研究人员在实验中如何避免上述问题的发生!
各种RNase抑制剂的比较
产品
Erasol
DEPC
RVC
RNasin
安全性
安全
强烈致癌
安全
安全
 
特性
强有力的RNase 抑制剂,不能在纯化过程中使用。
修饰蛋白质和RNA,不能在纯化过程中使用,与Tris等缓冲液不相容。
100%抑制Rnase,可在纯化过程中使用,但会影响RNA翻译,需最后用苯酚去除。
高效RNase抑制剂 可在纯化过程和后
续反应中使用。
使用
方便性
简单
繁琐
简单
简单
实验
兼容性
不影响RT-PCR等后续反应
严重影响RT-PCR等后续反应
不影响RT-PCR等后
反应
不影响RT-PCR等后续反应
效果
高效,比DEPC强10倍以上。
一般
高效
高效
用途
实验台和器材处理
器材和水的处理
用于反应体系中
用于反应体系中
经济性
便宜
便宜
一般
昂贵
 
一、实验准备
1. 实验台及器材的处理:
RNA实验最好采用专用的实验台和器材,而且必须在使用前进行处理以去除RNase。此点很多人会不太重视,但实际上很可能影响实验结果。
特别推荐:Erasol: RNase的终结者(绝对不含致癌物质!
主要用途
彻底去除残留在玻璃和塑料等表面的RNase。
适用范围
玻璃器皿、塑料器皿、金属器械、实验台面、反应试管等。
 
高效快速
室温下5分钟内能使多达100μg的RNase失去活性。
使用简单
喷后擦干即可,免去高温和DEPC处理,尤其适合于清洁电泳槽,实验台面等不容易用常规方法清洁的地方。
不影响RT/PCR
Erasol处理离心管后可以直接用于RT-PCR反应。
可重复使用
Erasol原液可以重复使用三次而效力不减。
比DEPC水有效
Erasol杀灭RNase的效力是DEPC水(含0.1%DEPC)的十倍以上。
安全
绝对不含致癌物质!而DEPC强烈致癌。
 
 
使
 
 
 
 
 
工作平台的清洁
直接将Erasol喷于台面,5分钟后用普通吸水纸擦净,最后用沾有Erasol新鲜稀释液的吸水纸擦净, 晾干。
实验仪器的清洁
用浸有Erasol的纸擦拭仪器表面,再用吸水纸擦净,最后用沾有Erasol新鲜稀释液的吸水纸擦净,晾干。用Erasol处理金属器械的时间不能超过5分钟。
玻璃和塑料器皿的清洁
喷洒足够多的Erasol将器皿表面全部覆盖,静置处理5分钟后倒弃溶液,用Erasol新鲜稀释液浸泡二次以上,倒立晾干后备用。
移液枪的清洁
根据生产厂家的使用手卸下移液枪的前端,留下接口塞和圈套后将其浸放在Erasol中一分钟,用Erasol新鲜稀释液彻底冲洗后,晾干,装回移液枪。
塑料离心管和滴头的清洁
将反应塑料离心管和滴头充分浸泡在Erasol中5分钟以上(最好不要有气泡),然后再用Erasol新鲜稀释液充分浸泡两次,试管或离心管可立即使用或干燥后备用。 (实验发现经Erasol原液处理过的试管或离心管可直接用于RT-PCR,但建议最好用Erasol新鲜稀释液浸泡)。
操作须知:使用前请将其稀释1000倍,建议每次使用新鲜液。
注意事项:不能直接加入反应液中,有腐蚀性,避免与皮肤接触。
  使用手册:请登录www.biolife.com.cn(技术支持)浏览,或E-mail (info@biolife.com.cn)索取。
订货信息
产品名称
规格
编号
价格(元)
Erasol
50 mL
1209-50
140
Erasol
100 mL
1209-100
240
Erasol
250 mL
1209-250
490
DEPC
10ml
Amresco
172
RVC
10ml
国产
490
RNasin
2500u
上海Promega N2111S
225
RNasin
2500u
Promega N2111
700
 
2.试剂准备: 一般先用DEPC处理水,高压灭菌后备用。再用DEPC处理过的水去配制其它的缓冲液。最后在实验反应液中加入RVC或RNasin进行实验。
3.注意事项: 此试剂为实验台和实验器材处理专用;操作人员应戴手套(须经过Erasol处理)。
二、样品的收集和保存
一般实验样品主要有:血液、组织液、病毒、培养细胞和植物等,每类样品均有其特点,在收集和保存时要予以重视。
注意事项:1. 在样品中加入新鲜保存液(RNAin)。
2. 尽量避免剧烈的机械操作(刮取细胞、研磨、剪碎等)。
3. 时间尽量短一些。
特别推荐RNAIN: 非冻型RNA样品保存液
主要用途
在非冻状态下保持新鲜组织细胞中RNA分子的完整性。
适用范围
RNA病毒、细菌、果蝇、植物组织、动物组织、培养细胞、悬浮细胞 (白细胞、流式细胞仪收集的细胞)等。
 
 
 
 
 
 
操作简单
将组织剪薄浸没在RNAIN中即可使其RNA不被降解。
替代液氮
使样品的保存不需液氮,干冰或-80℃冰箱, 尤其适用于临床和野外样品的快速和大规模采集。
RNA完整
RNAIN能迅速抑制组织中RNA酶的活性, 故从中提取的RNA的质量跟液氮保存的样品相比有过之而无不及。
方便运输
处理过的样品能在25℃保存一周, 使样品邮寄和运输变得容易和便宜, 有利学术合作和交流。
反复冻融
RNAIN处理的样品可反复冻融20次, 其间可对样品进行各种处理而不影响最终提取的RNA的质量。
结果准确
RNAIN进入细胞十分快速, 基因表达在发生应急改变之前就得以锁定, 故RNA分析更能反映取样时的真实情况。
可比性强
RNAIN能减少大规模样品处理中的误差, 增加各次实验数据间的可比性,对大规模基因表达谱的分析尤其有用。
兼容性广
虽然处理过的样品最好用RNAOUT提取其RNA, 但也能用TRIzol等试剂, 样品还可直接用于组织切片,免疫学和流式细胞分析而不影响RNA提取的质量。
注意事项:不能用于保存冷冻组织和冻融组织。如RNAIN™有沉淀,用前需加热到37℃, 摇晃, 待其溶解后方可使用。
使用手册:请登录www.biolife.com.cn(技术支持)浏览,或E-mail (info@biolife.com.cn)索取。
定货信息:
产品名称
规格
编号
价格(元)
RNAin
10ml
1206-10
99
RNAin
25ml
1206-25
149
RNAin
50ml
1206-50
299

比TRIzol快!

三、总RNA的提取
目前此类试剂较多,研究者应根据样品进行选择。一般分为两类:
1. 一般样品的RNA提取试剂:
主要采用异硫氰酸胍和酚类等成分的提取试剂,如Trizol、RNAout 等。
特别推荐RNAOUT: RNA快速提取液10分钟超快速提取!
主要用途
用于从RNAIN保存的样品中快速提取RNA, 但也可用于新鲜样品和液氮保存的样品。
适用范围
RNAIN保存的样品, 新鲜样品和液氮保存的样品。样品种类涵盖病毒、细菌、昆虫、植物组织、动物组织、培养细胞、悬浮细胞等几乎所有生物学材料。
性能指标
RNA产量一般为4-8μgRNA/mg组织, 5-10μg RNA/10E6个细胞。OD260/280一般在1.8-2.0之间。
操作简单
整个过程约10分钟, 比同类产品TRIzol短30分钟, 减少了污染RNase和RNA降解的机会, 适合大规模样品处理。
RNA完整
强变性剂在裂解细胞或病毒的同时也灭活了内源和外源的RNase, 保证了RNA的完整性。
RNA纯净
酸性条件使RNA与DNA得以分离, 有机条件使RNA与蛋白质得以分离。
注意事项:不能用于提取DNA和蛋白质,有腐蚀性。
使用手册:请登录www.biolife.com.cn(技术支持)浏览,或E-mail (info@biolife.com.cn)索取。
定货信息:
产品名称
规格
编号
价格(元)
RNAOUT
10ml(10次提取)
1207-10
149
RNAOUT
50ml(50次提取)
1207-50
499
RNAOUT
100ml(100次提取)
1207-100
699
Trizol
100ml
Invitrogen 15596026
1460
RNA提取试剂盒
30次
自产
460
MagExtractor-病毒RNA  Kit
50次
东洋坊NPK-401
800
MagExtractor-tRNA  Kit
50次
东洋坊NPK-200
1300
SV Total RNA Isolation System
50次
Promega Z3100
1430
2.植物样品的RNA专用提取:
特别推荐RNAall植物总RNA快速提取试剂盒
主要用途
适用于异硫氰酸胍/酚/氯仿法难以提取RNA的真菌样品和植物样品, 迄今为止提过四十余种常见植物(名单见附录), 成功率为100%。
 
性能指标
RNA产量(以100 mg组织计算)一般为种子100-120 ug, 叶片30-60 ug, 果实20-40 ug, OD260/280比值一般在1.9以上。纯化的RNA可用于Northern分析,PolyA RNA纯化,Dot Blot分析, in vitro转录,RNase保护实验,分子克隆和RT-PCR。
 
操作简单
整个过程约15分钟, 室温操作, 比同类产品操作时间短, 减少了污染RNase和RNA降解的机会,适合大规模样品处理。
RNA完整
强变性剂在裂解细胞或病毒的同时也灭活了内源和外源的RNase, 保证了RNA的完整性。
RNA纯净
酸性条件使RNA与DNA得以分离, 有机条件使RNA与蛋白质得以分离,助提剂能使RNA与多糖和多酚等成份得以分离,无DNA污染。
注意事项:不能用于提取DNA和蛋白质,有腐蚀性。
使用手册:请登录www.biolife.com.cn(技术支持)浏览,或E-mail (info@biolife.com.cn)索取。
定货信息:
产品名称
规格
编号
价格(元)
RNAall
50次微量提取
1218-50
790
10次微量提取
1218-10
198
四.mRNA的纯化
mRNA的纯化一般采用试剂盒,常用试剂盒的订购信息如下:
MagExtractor mRNA  Kit
5次
东洋坊NPK-801
2000元
PolyATtract mRNA Isolation System II
3次
Promega Z5200
1200元
PolyATtract mRNA Isolation System III
15次
Promega Z5300
1200元
五、纯化RNA的保存
特别推荐RNAMATE: 纯化的RNA长效保存液
主要用途
溶解和保存纯化的RNA, 用于RNA的常规保存和的邮寄运输。
适用范围
常规RNA保存、RNA样品的邮寄和运输。
使用简单
直接用来溶解RNA沉淀, 替代DEPC水。
抑制作用强
比人胎盘RNase Inhibitor抑制作用强五倍,比氧钒核糖核苷复合物(终浓度20mM)强上百倍。
稳定性好
100℃保温30分钟后对RNase的抑制活性没有任何影响。不需要DTT等还原剂, 反应的有效pH范围广。
 
注意事项RNAMATE会抑制RT-PCR反应,RNA需用LiCl沉淀一次后才能用于RT-PCR反应。
使用手册:请登录www.biolife.com.cn(技术支持)浏览,或E-mail (info@biolife.com.cn)索取。
定货信息:
产品名称
规格
编号
价格(元)
RNAMATE
500μl (500u)
1208-500
199
RNAMATE
1ml (1000u)
1208-1
299
RNAMATE
5ml (5000u)
1208-5
1290
LiCl
1ml
1217-1
20
六、纯化RNA的纯度判定
1. 提取总RNA的OD260/OD280值一般在1.9以上,OD260/OD230一般在1.8-2.2之间,如果低于此范围则分别表示样品可能有蛋白质或多糖的污染,但一般不影响RT-PCR等反应。
2.     注意不要将RNA稀释在蒸馏水和DEPC水中检测OD260和OD280,因为蒸馏水和DEPC水的pH值偏酸(约为6.5,由DEPC分解产生的二氧化碳溶于水中变成碳酸引起),使OD260/280比值比在TE中测得的比值低10%-15%。
3. 如果蛋白质污染严重,可以用酚/氯仿抽提后酒精沉淀;如果多糖污染严重,可以用终浓度为2M的LiCl再沉淀RNA一次;本实验室推荐的产品提取的RNA一般不含有DNA污染,在极少数情况下如果有DNA污染(RT-PCR反应时不加逆转录酶的反应也有PCR扩增)而该污染又需要去除,则可以用RNase-free DNase处理样品。
七、RNA的电泳检查
1.       电泳时同样要注意RNase的污染问题,若试剂中有Rnase,由于电泳的温度和时间较长,对RNA会有较大影响。
2.       使用微量RNA助沉剂,可以帮助RNA沉淀回收。
3.       使用RNAon即用型RNA变性上样液可以让你直接电泳上样,不必再单独加变性液,EB和上样液等。
4.       使用RNAsharp可以帮助克服电泳弥散现象。
5.       10XRNA电泳液让你省去了配制的麻烦。
6.       RNA中是否含有DNA污染需要通过琼脂糖变性胶电泳检测,如果有DNA,则上样孔会有红色荧光物。污染的DNA可以通过加入RNase-free DNase去除。
特别推荐
品   名
规格
货号
价格
产地
RNA Markers (Range: 281-6583bases)
50ul
G3191
740元
Promega
Agarose  琼脂糖
10g
 
40元
Amresco
Agarose  琼脂糖
100g
 
260元
Amresco
10XRNA电泳液
100ml
1215-100
149元
国产
RNAon即用型RNA变性上样液
1.5ml
1200-15
99元
国产
RNAsharp
10ml
1213-10
149元
国产
RNAdown
0.1ml
1211-01
90元
国产
 
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